Mit Hilfe kultivierungs-unabhängiger Methoden wurde die prokaryotische Diversität in Sedimentproben des afrikanischen Sodasees Lake Magadi (Rift Valley, Kenia) untersucht. Die molekularbiologische Analyse umfasste im Einzelnen: a) Extraktion der Gesamt-DNA; b) PCR-Amplifikation mit Bacteria und Archaea spezifischen 16S rDNA Primern; c) Ligations-unabhängige Klonierung der PCR-Produkte; d) Screening der Klonbanken mittels Hybridisierung, ARDRA und partieller Sequenzierung; e) vollständige Sequenzierung von 16S rRNA Genen. Die bei der Analyse der Bacteria-Klonbanken detektierten Sequenztypen konnten vorwiegend den Phyla Cyanobacteria (insbesondere “Euhalothece”-Gruppe), Firmicutes (Bacilli und Clostridia), Alpha-, Gamma-, und Delta- Proteobacteria sowie Bacteroidetes zugeordnet werden. Die Sequenztypen der Archaea-spezifischen 16S rDNA Klonbank ließen sich dem Phylum der Euryarchaeota zuordnen, wobei hauptsächlich Vertreter der Familie Halobacteriaceae detektiert wurden. Desweiteren wurden mehrere haloalkaliphile Archaea-Isolate, aus den salinen und alkalinen Habitaten Wadi Natrun (Ägypten) und Owens Lake (Kalifornien), molekularbiologisch sowie genotypisch charakterisiert. Diese Organismen ließen sich drei großen Linien innerhalb der bekannten Halobacteria zuordnen, die die Gattungen Natronomonas und Halorubrum, sowie Natronobacterium gregoryi und Verwandte umfassen. Diese Untersuchungen erbrachten den Nachweis bisher unbekannter Archaea- und Bacteria-Sequenztypen und geben damit neue Einblicke in die prokaryotische Diversität in Sodasee-Habitaten.
